很久以前，无人居住的山里建立有人类最新的研究中心                                                                      　　某日，研究用的main computer突然拥有自己的意识而暴走，人类费尽千辛万苦阻止了暴走，取回了和平……看起来是这样的                                                                      　　回到和平生活的人们，为了预防敌人再次暴走袭来，而准备了巨大萝卜，并选出战士们进行训练，某日，这一天终于来临了                                                                      　　站在袭来的敌人们面前的队伍，就是特命战队Go Buster！！ 他们的战斗，现在开始！

表面上看来，索尼娅是一个扎着双马尾的金发美少女高中生，但实际上，她有着异常敏锐的神经，能够感应到突然靠近她的生物。少女折部安奈自称是索尼娅的朋友，但似乎没有得到索尼娅的认可，性格迥异的两位少女，开始了...

2012年10月20日発売予定のコミック版第6巻限定版ブルーレイにテレビ未放送の第2期第11話を収録予定